样品收集由参与的公用事业公司完成。该计划依赖于我们的公用事业合作伙伴对样品进行正确的收集、处理和存储，直到样品被送往实验室 DCLS。
收集的样本主要有两种类型：抓取样本和复合样本。
- 抓取样本是在某一时刻采集的单个样本。这种类型的样本代表了采集样本时流入处理厂的废水。
- 复合样本是在24小时的时间段内收集的单个样本，然后组合在一起形成单个样本。可以按照设定的时间（例如，每10分钟）或根据进入污水处理厂的流量来收集样本。这种样本代表了流入污水处理厂的全天流量。
该实用程序提供样本附带的附加信息（元数据），例如样本采集时间、采集当天的流量和采样点。所有样品均在处理厂入口处收集，然后进行任何重大处理。
样品被运送到 DCLS 进行浓缩、提取和液滴数字聚合酶链式反应 (ddPCR) 分析。在15年 11 月2021日当周之前，提取的样本被运送至汉普顿路卫生区 (HRSD) 的 NELAP 认证实验室，通过 ddPCR 进行 SARS- COV 2分析。 本报告中提出的基因靶标是 ddCoV_N，它是 N 2基因的修改版本，用于 ddPCR 废水分析[ 1 ]。 在无模板对照（NTC）中观察到扩增的定量结果将从分析中删除。当前版本实验室方案（v 2 . 0 ）的检测限为6 , 200份/升废水。所有低于检测限的浓度均被赋予一个等于检测限一半的值。
| 实验室协议版本 | 检测限（LOD） | 实验室职责 |
| 版本2 . 0 | 6,200 | 浓缩、提取和 ddPCR 分析： 直流电流 |
| 版本1 . 0 | 1,350 | 浓缩和提取： 直流电流
液滴数字聚合酶链式反应（ddPCR）分析： HRSD |
病毒载量根据公式1计算：
（ 1 ）病毒载量（拷贝/天）=病毒浓度。（份/升）∗流速（MGD）∗（ 3785411 . 8L/d)/( 1 MGD)
百分位数是根据每个站点的病毒载量计算的，然后分成五等分（即0 - 19 . 9 th，20 - 39 . 9次，40 - 59 . 9个，60 - 79 . 9个，80 - 100次）。特定于站点的百分位数提供了一种指标，用于将当前周的数据与站点的历史数据进行比较，从而可以通过颜色可视化的方式显示每个站点何时经历最高负载和最低负载。
参考
[ 1 ] Gonzalez, R.、Larson, A.、Thompson, H.、Carter, E. 和 Cassi, XF ( 2021 )。重新设计 SARS- COV 2临床 RT-qPCR 检测废水 RT-ddPCR。 https://doi.org/ 10 。 1101 / 2021 。 03 。 02 。 21252754